Plzeňská zoo má pestrou historii se stěhováním z Doudlevec, sloučením s botanickou zahradou; souvislost s amfiteátrem Lochotín, Parkem kultury, pionýrskou železnicí... Vícekrát měnila svůj statut - byla zřizována spolkem Iris, poté patřila pod Národní výbor a do Parku kultury a oddechu. Má i řadu historických milníků: vznik spolu Iris (1901), otevření zoo (1926), uzavření areálu v Doudlevcích (1961), otevření BZ (1961), otevření Akva Tera (1962), otevření nové zoo (1963); sloučení zoo a BZ + osamostatnění, tzv. delimitace (1981). Generel a začátek modernizace (1996).

Teprve kolem roku 1996 začíná ve větší míře k funkci rekreační přibývat podíl na ochraně přírody, složka vzdělávací, vzrůstá i množství ohrožených druhů, chovaných a rozmnožovaných v Plzni.

Největší úspěchy v historii:

Československý prvoodchov sajgy tatarské (1960)

Československý prvoodchov  zoborožce černobílého (1976)

Československý prvoodochov outloně váhavého (1977)

Československý prvoodchov  krokodýla - kajmana žakaré (1980)

Československý prvoodchov  plameňáka chilského  (1984)

Československý prvoodchov anakondy velké (1984)

Světový prvoodchov varana modrého (2006)

Česko-slovenský prvoodchov lemura rákosového (2016)

Česko-slovenský prvoodchov ježury novoguinejské (2019)

Česko-slovenský prvoodchov zoborožce celebeského (2020)